Kota y el niño cuenta una historia real en la que un artista japonés llega al pueblo de un niño que sueña con ser, como él, pintor. El japonés, de nombre Kota, instala su caballete, mirando hacia el mar, justo a la salida de la casa del niño, que decide no perderse ni una pincelada del cuadro. Sin embargo, hay algo que le extraña mucho: lo que Kota quiere pintar. Durante los cuatro días que pasan juntos van creando vínculos y algo en la mente del niño se va transformando. Cincuenta años después de aquel encuentro, sin que tuvieran noticias el uno del otro, sucede algo tan real como mágico entre ambos.